近日,浙江大學(xué)、清華大學(xué)分別在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊Science、Cell刊發(fā)最新研究成果。
浙江大學(xué)
3月31日,浙江大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院周龍團(tuán)隊(duì)與美國(guó)加州大學(xué)戴維斯分校JamesLetts團(tuán)隊(duì)合作在Science期刊以Research Article的形式在線發(fā)表了題為“Structures of Tetrahymena ’s respiratory chain reveal the diversity of eukaryotic core metabolism”?的研究論文,解析了纖毛綱重要模式生物嗜熱四膜蟲(Tetrahymena thermophila, Tt)線粒體的氧化磷酸化電子傳遞鏈(electron transport chain, ETC)超復(fù)合體I-III2(SC I+III2)及復(fù)合體IV二聚體(CIV2)分別2.6?與3.0?的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)。
JamesLetts博士是本文的通訊作者,浙江大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院周龍博士與UCD María Maldonado博士是本文共同第一作者,參與合作的還有Abhilash Padavannil博士與UCD電鏡平臺(tái)主任郭飛博士。
嗜熱四膜蟲SC I+III2分子量達(dá)到2.3 MDa,由91個(gè)亞基組成;相比較下哺乳類SC I+III2分子量?jī)H1.4 MDa,67個(gè)亞基。四膜蟲復(fù)合體I核心亞基分裂成17個(gè),打破了哺乳類14核心亞基的布局;其51個(gè)附屬亞基中有20個(gè)為本研究首次發(fā)現(xiàn)。
值得注意的是,與哺乳類不同,四膜蟲復(fù)合體I并不存在“激活-失活”兩種狀態(tài),結(jié)構(gòu)上也沒有膜內(nèi)外兩臂夾角改變導(dǎo)致的“開放-閉合”兩種構(gòu)象。對(duì)于這種持續(xù)激活的復(fù)合體I,其CoQ通道附近對(duì)底物回轉(zhuǎn)有重要意義的幾個(gè)環(huán)區(qū)(ND3 TMH 1-2等)均與 “閉合”態(tài)的哺乳類復(fù)合體I一致。
這提示“開放-閉合” 的構(gòu)象轉(zhuǎn)變或許并非真核復(fù)合體I普遍保守催化機(jī)制的一部分,也為長(zhǎng)期激烈爭(zhēng)論的復(fù)合體I工作機(jī)理的研究提供了新思路。
這項(xiàng)研究的特色在于,從一個(gè)經(jīng)典模式生物入手,在結(jié)構(gòu)、功能、調(diào)控等多個(gè)層面密集地打破了ETC復(fù)合體的現(xiàn)有范式,為領(lǐng)域研究注入了新的活力。同時(shí),本研究使用了從一套單顆粒數(shù)據(jù)中同時(shí)解析幾個(gè)復(fù)合體結(jié)構(gòu),以及完全依靠電子密度與蛋白質(zhì)組從頭建模等前沿冷凍電鏡技術(shù)。
一位匿名評(píng)審專家在審稿意見中說:“對(duì)我而言,閱讀這份稿件確實(shí)是一次瞠目結(jié)舌的體驗(yàn)(Reading the manuscript for me was truly a jaw-dropping experience)”。
清華大學(xué)
4月1日,清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院葛亮副教授、藥學(xué)院張敏研究員和浙江大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院易聰研究員以共同通訊作者身份在《細(xì)胞》(Cell)期刊上發(fā)表了題為“聚集體自噬受體CCT2介導(dǎo)固態(tài)聚集體清除”(CCT2 is anaggrephagy receptor for clearance of solid protein aggregates)的研究論文。
清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院2017級(jí)博士生馬欣宇為第一作者,2017級(jí)博士生盧彩景為研究作出了重要貢獻(xiàn),浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院2020級(jí)博士生陳禹亭、清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院2019級(jí)博士生李樹林、2020級(jí)博士生馬寧佳、2018級(jí)博士生陶旋參與了實(shí)驗(yàn)。李丕龍副教授、鄧海騰教授和閆永彬副教授等也對(duì)該工作提供了重要幫助。
在此項(xiàng)研究中,清華大學(xué)生命學(xué)院葛亮課題組發(fā)現(xiàn)了一種新型的聚集體自噬受體CCT2,能夠促進(jìn)多種與神經(jīng)退行性疾病相關(guān)的毒性蛋白聚集體的自噬性清除。與傳統(tǒng)聚集體自噬受體一樣,CCT2能夠與LC3和蛋白聚集體結(jié)合。
不同的是,CCT2通過其頂端結(jié)構(gòu)域(apicaldomain),以非泛素依賴的方式結(jié)合蛋白聚集體,這為CCT2特異性地識(shí)別聚集體提供了基礎(chǔ)。重要的是,研究發(fā)現(xiàn)CCT2和傳統(tǒng)的聚集體自噬受體在對(duì)聚集體狀態(tài)的選擇上有很大的差異:傳統(tǒng)的自噬受體更傾向于降解有流動(dòng)性的液態(tài)聚集體,而CCT2則更傾向于選擇固態(tài)的聚集體。因此相比已知自噬受體,CCT2更有可能在病理狀態(tài)下發(fā)揮作用并成為藥物靶點(diǎn)。
CCT2是分子伴侶Chaperonin復(fù)合體的一個(gè)亞基,與復(fù)合體一起作為分子伴侶幫助錯(cuò)誤折疊的蛋白正確地折疊。研究發(fā)現(xiàn),CCT2是以單體形式介導(dǎo)聚集體自噬的,因?yàn)橹挥袉误w形式的CCT2能夠暴露出與LC3的結(jié)合位點(diǎn)VLIR結(jié)構(gòu)域。
有趣的是,聚集體的存在阻礙了Chaperonin復(fù)合體的形成,從而釋放出更多的CCT2單體來促進(jìn)聚集體的清除。CCT2從復(fù)合體到單體的轉(zhuǎn)變,使其功能從分子伴侶轉(zhuǎn)變?yōu)樽允墒荏w,這既能夠在聚集體形成前防止錯(cuò)誤折疊的蛋白發(fā)聚集,又能在發(fā)生聚集后介導(dǎo)聚集體的清除,為維持細(xì)胞內(nèi)的蛋白穩(wěn)態(tài)提供了一種高效的方式。
此研究得到了膜生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、國(guó)家自然科學(xué)基金委、科技部、北京自然科學(xué)基金委、浙江省自然科學(xué)基金委和清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心等經(jīng)費(fèi)的支持。
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